1849年被Temmincket Schlegel命名拉丁学名。

19世纪30年代，黑脸琵鹭在中国东南沿海还比较常见，但是随着日益严重的水域污染及栖息地破坏等因素，分布区大为缩小，种群数量锐减，到19世纪80年代，种群数量已下降至不足300只，被世界自然保护联盟（IUCN）列入极危鸟类。基于此，1994年8月，全球第一次黑脸琵鹭保护会议在德国罗森海姆举行，来自日本、朝鲜、韩国、越南、中国等国的专家参加了会议。会议一致认为，全球应共同加强对黑脸琵鹭这一濒危物种的保护，并将“黑脸琵鹭保护行动计划工作”列入国际鸟类保护联盟亚洲计划的优先项目。1995年1月，有关专家又在中国台湾召开了黑脸琵鹭研讨会，并于同年9月制定出黑脸琵鹭保护的指导性文件—《黑脸琵鹭保护的行动计划》。1996年5月，由中国鸟类学会与日本野鸟学会联合主持，在北京召开了“保护黑脸琵鹭国际研讨会”，这次会议标志着黑脸琵鹭保护行动计划的正式启动。